Tras cerrar el negocio, el comerciante fue con su esposa hacia el Farmatodo de Vista Alegre en busca de una medicina.
En vista de que allí no consiguió lo que buscaba, el hombre dejó a su esposa en la farmacia y fue solo hasta otra en la calle 2. A su salida del local, el comerciante fue sometido por tres delincuentes que aguardaban afuera a bordo de otro vehículo.
Los sujetos obligaron a la víctima a darles la llave de la camioneta, pero cuando intentaron encenderla, no pudieron porque requería una clave. Juan Niño, en medio de los nervios, no pudo suministrar los dígitos y fue cuando le efectuaron un disparo que le impactó en el abdomen y le perforó los intestinos.
Los sujetos huyeron sin cometer el asalto, mientras que la víctima fue trasladada hasta el hospital Miguel Pérez Carreño, donde murió.